Мавераннахром самостоятельно правили сыновья Абу Сейида, сначала Султан Ахмад (1469—1494), затем Султан Махмуд (1494—1495) и, наконец, сын последнего — Султан Али (1498— 1501). Мавераннахр в это время фактически распался на множество почти независимых, враждовавших между собою владений темуридских царевичей и могущественных сановников. Это не могло не сказаться на экономической, политической и культурной жизни в Мавераннахре. Одновременно с этим усилилась роль духовенства, особенно суфийских шейхов, имевших большое влияние на широкие массы. Отдельные шейхи-наставники активно вмешивались в политическую жизнь страны, оказывая положительное воздействие на правителей.

Одним из них был Убайдулла Ходжа Ахрар, которому не раз доводилось предотвращать братоубийственные войны между Темуридами. Так было в 1454 году, когда правитель Хорасана Абулкасым Бабур осадил Самарканд и столкнулся с Абу Сейидом; в 1463 году, когда Абу Сейид осадил Шахрухию, где укрепился сын Абдуллатифа, Мухаммад Джуки, и, наконец, в 1469 году, когда под Хавастом большое войско правителя Самарканда Султан Ахмада столкнулось с войсками правителя Ферганы Омар Шейха и хана Ташкента Султан Махмуда. Ходжа Ахрар, прибыв на место военных столкновений, заставил противоборствующие стороны прийти к примирению.

Безусловно, хотя миротворческая деятельность Ходжи Ахрара была тесно связана с политической ситуацией того времени и направлена на укрепление власти имущих, благодаря его авторитету и влиянию страна не раз была защищена от очередных разрушений и страданий.