Оседание монгольских родов, пришедших в Мавераннахр, не происходило мирно. Наиболее плодородные поливные земли и пастбища были захвачены насильственно. Безусловно, был нанесен определенный урон земледельческому хозяйству местных крестьян. Некоторые из них были вынуждены покинуть родные места и переселиться в другие районы. Кроме того, наметился раскол между монголами скотоводами Семиречья и осевшими в Мавераннахре чигатаями. Семиреченские монголы с презрением смотрели на тех, кто переселился в земледельческие районы Мавераннахра и утратил чистоту степных традиций. Они пренебрежительно именовали их "караунасами", то есть метисами. В свою очередь, чигатаи Мавераннахра относились к своим сородичам из Семиречья, как к отсталым и грубым варварам. Называли их "джете" — разбойниками. Таким образом к 40-м годам XIV века Чигатайский улус постепенно разделился на две части: Мавераннахр и Моголистан.

Территория Восточного Туркестана, Южной Сибири и Семиречья Чигатайского улуса назывались Моголистан. В 1348 году ханом Моголистана был провозглашен Туглук Темур из рода Чигатаев. Западная часть улуса — Мавераннахр — оставалась независимой.