После смерти Элтузархана в 1806 году на трон сел его брат Мухаммад Рахим, приступивший к политическому объединению Хивинского ханства.

В то же время вопрос подчинения туркменов вышел на ведущее место. Несмотря на ожесточенное сопротивление, туркменские племена одно за другим покорились.

Не захотевшее подчиниться явмутское племя переселилось в Хорасан. Однако под давлением Иранского правительства, а также не имея пастбищ для своего скота, оно снова возвратилось на территорию Хивинского ханства. Теперь явмуты вынуждены были разместиться на территории, выделенной для них Хивинским ханством. С этого периода судьба явмутов окончательно связана с Хивинским ханством и они, так же как и все граждане, платили налоги. На них также возлагалось обязательство служить в ханском войске.

Войны и скитания в течение долгого времени отдалили явмутов от сельского хозяйства. Поэтому они преданно служили в ханском войске. Из их числа была сформирована боевая конная часть.

Мухаммад Рахимхан I, опираясь на войско, сформированное из узбеков и туркменов, вел борьбу против крупных аристократов, чтобы сломить их сопротивление. В этой борьбе один за другим стал подчинять своих противников. В 1811 году было сломлено сопротивление враждебной к Мухаммаду Рахимхану I группировки аристократов Аралбуя. Город Кунграт был разрушен. Хивинское ханство приступило к подчинению самостоятельно отделившихся каракалпаков. Каракалпаки стремились получить помощь от Бухарского эмира Хайдара. Но, не достигнув этого, были вынуждены подчиниться Хивинскому ханству.

В промежутке 1812-1820 годов дважды было организовано нападение на территорию казахов. В итоге территория ханства расширилась.

В 1813 году туркмены, обитавшие на севере Хорасана, также признали власть Хивинского ханства.

В 1822 году к ханству был присоединен город Мары.

В 1824 году построен город Новый Мары.

Мухаммад Рахимхан I одарил землей, имуществом и различными привилегиями аристократов подчинившихся племен, имевших могущественное положение среди своего народа. Этим самым была обеспечена политическая стабильность в ханстве.

Во времена Мухаммада Рахимхана I ханство было объединено центральной властью. В то же время была обеспечена и стабильность в стране. Ее территория еще более расширилась.

Во времена хивинских ханов Аллакулихана (1825-1842) и Мухаммада Амирхана (1846-1853) междоусобные войны не прекращались. Если Аллакулихан нападал на Бухару — 7 раз, на Хорасан — 5 раз, то Мухаммад Аминхан нападал на Мерв — 10 раз. Продолжались насилие, грабительство. Жизнь народа ухудшалась.