Известным ученым-историком Бухары был Мухаммад Якуб ибн Дониялбий Бухари
(1771-1831), живший и творивший в первой половине XIX века. Он оставил труд
«Гулшан-ул-мулук» («Цветник царей»). Книга состоит из двух частей. В первой
части рассказывается о древней истории Бухары, ее правителях, их династиях. Во
второй части рассказано об истории Средней Азии XVIII — начала XIX века.
Книга Мирзы Шамсы Бухари «Баёни баъде хаводисоти Бухоро, Хуконд и
Кашгар» («Описание некоторых событий Бухары, Коканда и Кашгара»), написанная в
XIX веке, тоже является ценным источником по истории.