Аштарханиды являются потомками Джаджихана. Начиная с 80-х годов XIV века они правили Аштарханом (Хаджи Тархан, Астрахань), народами и территорией вокруг него. Когда в 1556 году Астрахань была завоевана Россией, аштарханид Ермухаммадхан вместе с семьей и родственниками приезжает в Бухару. Бухарский хан Искандерхан (отец Абдуллахана II) встречает их с почестями. Свою дочь Зухру-бегим Искандерхан выдает замуж за сына Ермухаммадхана Джанибека-султана. Впоследствии у Джанибека-султана от Зухры-бегим родятся три сына: Динмухаммад, Бони Мухаммад и Вали Мухаммад. Джанибек-султан и его сыновья добиваются большого авторитета в Бухарском ханстве и активно участвуют в жизни ханства.

В 1601 году сын Джанибека-султана Бони Мухаммад садится на престол Бухары. Впервые в истории Бухарского ханства начинается период правления новой династии — Аштарханидов, которые правят в течение 175 лет.