Алимхан с целью централизации своей власти в Кокандском ханстве осуществил также и внутренние
реформы. Он отменил звание "ишан", считающееся религиозным саном. Он выделил
беднякам и странствующим дервишам земельные участки и скот, привлек их к труду.
Он устроил проверку отдельных религиозных деятелей и наказывал тех, кто не
соответствовал своему духовному званию. Улемы (верхушка мусульманского
духовенства) были недовольны такими действиями хана и организовали против него
заговор. В 1810 году они, воспользовавшись нахождением хана в Ташкенте,
распространили слухи о том, что "Алимхан умер в Ташкенте". На трон посадили его
младшего брата Умархана. Алимхан, узнав о предательстве, возвращается в
Коканд, однако погибает от рук заговорщиков.